Příběh LEGO Nindroids navazuje na LEGO Battles, které vyšlo pouze pro Nintendo DS v roce 2011. LEGO Ninjago Droids pro Nintendo 3DS bude mít 30 úrovní. Budete používat speciální combo útoky a budete mít k dispozici tajné zbraně, jako třeba Technoblades, které vám umožní proniknout do počítačů, řešit hádanky a bránit město.
V ulicích jezděte v pozemských Mech Cole a Jay Thunder Raider, braňte oblohu v Zanea Ninjacopter, unikněte z Pythor na Lloyd Golden Cycle a vydejte se na souřadnice epické závěrečné bitvy. Režim Story nabídne další oblíbené postavy, jako Nya, Sensei Garmadon, Samurai X, a PIXAL.
V LEGO Ninjago: Nindroids budete čelit své největší výzvě, při ochraně New Ninjago City před armádou Overlord’s Nindroid. Pronikněte do věže Borg, létejte s Kai Fighter a postavte se ďábelským Tech Wu.